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TEMA:* * *
Índice
de artículos:
Reliquias del Edén — reseña: un análisis crítico de la tesis de la descendencia común Capítulo IV (b) - Una falsa
tricotomía · Jonathan M.
Nuevo
análisis de una vieja historia
(I) · Los retrovirus y la descendencia común · Jonathan M. (II) · Los ERVs compartidos — ¿prueba de descendencia común? · Jonathan M. (III) · Más acerca de los ERVs · Jonathan M. |
En mis dos anteriores artículos (aquí y aquí), he estado explorando alguna de la información de trasfondo acerca de la integración de elementos retrovirales en genomas de primates y los diversos argumentos en favor de la descendencia común que se basan en ellos. He explorado, con un cierto detalle, la línea de prueba para la descendencia común basada en la ubicación compartida de secuencias retrovirales. En este último artículo abordaré las dos últimas cuestiones que se suscitan en el artículo de divulgación que he estado examinando. ¿Mutaciones
compartidas? Como hacen observar los autores: Una de las más asombrosas características que se ilustran en la Figura 1 es la gran cantidad de convergencia evolutiva que se observa entre linajes independientes. Doce de los sitios variables eran compartidos por diferentes linajes. Lo más sorprendente es que también aparecían convergencias dentro de sitios sinónimos y en regiones intergénicas. Las convergencias evolutivas durante la adaptación de los linajes virales bajo condiciones ambientales artificiales idénticas han sido descritas con anterioridad (Bull et al. 1997; Wichman et al. 1999; Fares et al. 2001). Sin embargo, este fenómeno se observa no sólo en el laboratorio. También es una observación relativamente extendida entre los clones del virus de la inmunodeficiencia humana (HIV)-1 aislados de pacientes tratados con diferentes fármacos antivirales; los cambios paralelos son frecuentes, y siguen a menudo un orden común de aparición (Larder et al. 1991; Boucher et al. 1992; Kellam et al. 1994; Condra et al. 1996; Martinez-Picado et al. 2000). Sustituciones subsiguientes pueden conferir unos crecientes niveles de resistencia al fármaco o, de manera alternativa, pueden compensar por efectos pleiotrópicos deletéreos de mutaciones anteriores (Molla et al. 1996; Martinez-Picado et al. 1999; Nijhuis et al. 1999). Además, se han observado convergencias moleculares entre virus de inmunodeficiencia quiméricos simio-humanos (cepa SHIV-vpu+) aislados de macacos cola de cerdo, monos rhesus y humanos después de bien una infección crónica, bien un paso rápido de un virus (Hofmann-Lehmann et al. 2002). Podría citar otros diversos estudios similares. Para otro caso práctico, véase Bull et al. (1997). LTRs y filogenia Una de las principales dificultades asociadas con el intento de erigir filogenias basadas en la divergencia entre las LTRs 5' y 3' es que se basan en el supuesto de que las dos LTRs acumulan mutaciones puntuales de manera independiente y que, por tanto, la divergencia refleja el tiempo transcurrido desde el suceso de inserción. Sin embargo, si hay conversión génica entre LTRs, la divergencia de nucleótidos será mucho menor a la esperada bajo el supuesto antes mencionado. Aplicando un método genómico comparativo a primates y a roedores, un artículo de Kijima e Innan (2010) emprende investigar la magnitud de conversión génica entre LTRs. Los autores observan: Hemos descubierto que la conversión génica juega un papel significativo en la evolución molecular de las LTRs en primates y roedores, pero la magnitud es bien diferente. En los roedores, la mayoría de las LTRs están sujetas a una conversión génica extensiva que reduce la divergencia, de modo que los resultados de métodos basados en divergencia resultan en una gran subestimación del tiempo de inserción. En primates, este efecto queda limitado a una pequeña proporción de LTRs. La explicación más probable de la diferencia involucra la longitud mínima de la secuencia interactuante (segmento de procesado eficiente mínimo [MEPS]) para conversión génica interlocus. Una estimación empírica de MEPS en los humanos es de 200-500 bp, que excede a la longitud de la mayoría de las LTRs analizadas. En contraste, la MEPS para los ratones debería ser mucho menor. Así, la MEPS puede ser un factor importante para determinar la susceptibilidad de las LTRs a la conversión génica, aunque hay muchos otros factores involucrados. Se concluye que el método de divergencia para estimar tiempos de inserción se debería aplicar con especial cautela porque al menos algunas LTRs experimentan conversión génica. [énfasis añadido] Resumen En ausencia de un
mecanismo naturalista factible que pudiera explicar
cómo pudo haber tenido lugar
una evolución desde un antecesor
común, ¿cómo podemos tener
ninguna seguridad de que realmente
fue así? En tal caso, uno debería
esperar de manera razonable que hubiese alguna
prueba espectacular de una descendencia
común. Sin embargo, y desafortunadamente para
los darwinistas, el respaldo para una descendencia
común es tenue como un papel de fumar. More Points on ERVs Jonathan M. May 28, 2011 10:00 AM | PermalinkTítulo y enlace con el original: More Points on ERVs - 28 Mayo 2011 Autor:
Jonathan M. licenciado en biología forense. ©
Jonathan M 2011 SEDIN |
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